Karyotyping er processen med at bestille og parring af alle de kromosomer, der findes i en organisme for at opnå en altomfattende oversigt over hele kromosomernes kort af et individ.
Men lad os først sørge for, at vi forstår, hvilke kromosomer der er i første omgang. Kromosomer er strukturer, der ligner tråde, der er indeholdt i kernen i hver af kroppens celler.
Hver kromosomstruktur indeholder hele din genetiske informationsplan for din krop. Dette dikterer måden din krop er struktureret på, reagerer på stimuli, disponering mod sygdomme mv. Kvinder har 2 'X' kromosomer, og mænd har et 'X' og et 'Y'-kromosom. Hver celle i din krop indeholder 23 par kromosomer, i alt 46 kromosomer.
For at forskere skal kunne forstå kromosomernes sekvenser for hver patient, bruger de karyotypingssoftware . Denne type software er designet til at udføre kromosomanalyse, og det evaluerer strukturen og antallet af en persons kromosomer. Ved at gøre dette kan forskere og forskere opdage abnormiteter.
I denne artikel vil vi udforske nogle fantastiske software muligheder, der giver dig mulighed for at udføre karyotyping analyse.
- 1
ArgusSoft
ArgusSoft er en fantastisk software løsning, der giver dig mulighed for automatisk at karyotype menneskelige kromosomer ved båndposition og kan også bruges til karyotypning af dyr og plantens kromosomer online.
Nøglefunktioner:
- G, Q, R farvning
- Automatiseret karyotypning af menneskelige kromosomer med anerkendelse af bøjninger
- Automatiseret karyotypning af svinekromosomer
- 3 indbyggede baser af standard ideogrammer af menneskelige kromosomer med forskellige clearence niveauer - 400, 550 og 850 niveauer
- Kan tilføje baser af standardkromosom ideogrammer til andre dyre- og plantearter
- Prøveforberedelsesmetoder
- Input af metafasepladebilleder ved hjælp af et kamera og en scanner
- Medfølgende et billede med grafik
- Automatiseret opdeling af påført og kontaktende kromosomer
- Sammenligning af kromosomer og ideogrammer
Du kan også bruge ArgusSoft til at træne systemet for kromosomer genkendelse ved hjælp af præ-set præparater, kan overføre metafase plade billeder og karyogrammer i indbygget database, kan producere mønstre af rapporter, korrigere karyogrammer og også gemme og udskrive billeder og analyseresultater.
Du kan få træning og støtte til at bruge ArgusSoft fra deres officielle hjemmeside. Supportcenteret omfatter trænings-, vedligeholdelses- og konsulenttjenester.
Prøv ArgusSoft
- 2
HiBand ved Anvendt Spektral Imaging
HiBand er en software skabt af Applied Spectral Imaging, der kan udføre avanceret kromosomanalyse ved hjælp af digitale karyotypegenskaber. Denne software
bruger automatiserede scanningsfunktioner til en dybtgående analyse af kromosomstrukturen.
Du kan bruge den brede vifte af funktioner, der findes i HiBand til indeksering, tælling, lagring og styring af resultatdata. Du kan også bruge denne kraftfulde software til automatisk at scanne kromosomsekvensen.
Resultaterne opnået ved brug af karyotypingsfunktionerne fundet HiBand kan opbevares på et sikkert sted med adgangskodebeskyttede og krypterede lag. Dette giver dig ro i sindet med at miste vigtige sekventeringsdata, og på den måde forbedrer du også dit laboratories effektivitet.
Sortering gennem resultaterne foregår på en meget nem måde, du skal blot søge efter den specifikke kromosomsekvens, og alle resultater vises på en indbygget skærm, der giver nem adgang til at ændre, gennemgå og også tilføje tags til enhver af filerne.
Nøglefunktioner:
- Brightfield Karyotyping-G-Band og R-Band
- Fluorescens Karyotyping-Q-Band, R-Band og FISH
- Spektral Karyotyping
- Automatisk kromosometælling
- Kromosom indeksering og klassificering
- Avanceret adskillelse af kromosomer og avanceret billedforbedring
- Billedgalleri - kan præsentere alle tilfælde metafaser og karyotyper på en skærm
- Kan sammenligne kromosomer - se dem side om side
- Abberant Ideogram - Du kan tilføje kromosomer, celler, ideogrammer og annoteringer i en billedgenerator
HiBand bruger fuldt automatiserede workflows til at øge lab effektiviteten, har start-og-walk-away scanningsfunktioner, finder metafaser, læser automatisk stregkoder, uploader billeder i realtid under dias scanning og eksporterer også til lab LIS Central Portal og Database.
Prøv HiBand
- 3
Ikaros af MetaSystems
Dette karyotypesystem har en meget intuitiv brugergrænseflade, der tilbyder alle funktionerne på en skærm. Dette giver nem og hurtig adgang til alle de opnåede oplysninger.
Ikaros kan bruges sammen med Neon, som er en platform designet til at hjælpe med billeddata og case organisation. Neon indsamler data fra alle billedopgaver, eksterne kilder og giver dig mulighed for at præsentere dem på en let forståelig måde ved hjælp af et case management dashboard.
Dette værktøj giver dig mulighed for altid at få vigtige oplysninger tæt på hånden og gemt på en sikker måde, men bruger meget stærke dataadministrationsalgoritmer, har en god række måder at observere data på og kan give specifikke søgninger baseret på søgeord og dataegenskaber.
Tjek mere information om Neon og dens funktioner her .
Ikaros understøtter mange forskellige bandingsteknikker - Brightfield G-Band og R-Band, Fluorescens Q-Band, R-Band og FISH -, tilbyder et stort antal præ-definerer karyogramformer til mennesker, planter og dyr. Du kan nemt redigere disse formularer for at tilføje de nødvendige data til den type forskning, du laver.
Det faktum, at du kan sammenligne kromosomer ved klassen eller ved karyogrammer, giver dig meget nyttige oplysninger, der gør det nemt at identificere forskelle.
Prøv Ikaros
- 4
MetaClass af Microptic
MetaClass er en stor karyotyoprogramvare, der er udviklet modulært. Denne software hjælper dig med at udføre karyotyping og FISH studier af kromosomer.
MetaClass er dannet ud fra følgende moduler:
- MetaClass Database
Database, der kan installeres med nogen af MetaClass-modulerne. Tillader dig at gemme patientoplysninger og giver dig nem adgang til resultater. Du kan oprette tilpassede rapporter på ethvert sprog med dette modul.
- MetaClass Karyotyping
Giver dig mulighed for at studere en karyotype, efter at billederne af metafasepræparatfasen er blevet digitaliseret og arrangeret i par baseret på størrelse, position osv. Dette modul giver dig fremragende kvalitetsresultater, når det kommer til kromosombånd, og det kan også give dig professionelle udseende rapporter.
Nøglefunktionerne omfatter:
- Undersøgelsen af karyotype analyseres under brightfield 100X forstørrelse
- Kan fange adskillige metafasebilleder
- Billedkvalitet er modificerbar til skarpere resultater
- Automatisk klassificering af kromosomer
- 4 skærmvisninger - Metaphase, Karyotype og Unclassified chromosomes vindue
- Kan vise kromosom prototyper
- Kromosomer, der ikke er klassificeret, kan automatisk eller manuelt korrigeres - overlejringer, adskillelse, krydsninger, rotationer mv.
- MTC-session filer eller BMP-billeder kan gemmes og genindlæses til enhver tid
- Kan eksportere individuelle kromosomer til Metaclass Database med mulighed for at tilføje kommentarer og noter
Her er et eksempel på en Metaclass karyotyping rapport.
- MetaClass FISH
Dette er et analysemodul, der giver dig mulighed for at opnå fluorescerende IN SITU-hybridisering (FISH) -billede. Dette modul indfanger billeder ved hjælp af fluorescerende DNA-prober, og giver dig mulighed for at bekræfte genetiske abnormiteter - trisomier, mocrodelektioner, kromosomomlejringer osv.
FISH-billeder analyseres under 100X forstørrelse og kan for et bredere spektrum af billedklarhed også tage billeder med forskellige filtre.
Hvis du er interesseret i at finde ud af mere information om de ovennævnte moduler og andre funktioner, kan du kigge gennem MetaClass kataloget.
Hvis du er en nysgerrig type og vil se en rapport opnået ved at bruge FISH-metoden, kan du
en prøve PDF-fil.Prøv MetaClass
- 5
GenASis Bandview
GenASis Bandview er en anden stor karyotyping software, der er bygget ud af moduler med forskellige capabitilites. Du kan bruge denne app til at udføre karyotypediagnostik og opnå nøjagtige testresultater.
Denne software giver dig mulighed for fuldt ud at tilpasse arbejdsgangen og diagnoseprocessen afhængigt af virksomhedens behov og de mål, du forsøger at opnå.
Det omfattende udvalg af værktøjer, der leveres i BandView, er let tilgængelige med et enkelt klik med musen og tilbyder kraftig G / R / C / Q-Band karyotyping oplevelse. Du kan vælge mellem en automatiseret eller manuel arbejdsproces, når det kommer til at lokalisere metafaser og tage billeder.
Kromosomabnormiteter, hvis de findes, kan observeres ved tilsætning, sletning eller omlægning af patientens genetiske materiale. Med BandView kan du bruge bånd af FISH molekylær teknik.
FISH bruger flourescent prober til at knytte til forskellige dele af kromosomet, hvilket gør det muligt for softwaren at opdage og lokalisere de abnormalititter, der findes i specifikke DNA-sekvenser.
Prøv GenASis Bandview
Konklusion
I denne artikel undersøgte vi nogle af de bedste automatiserede karyotypingssoftware, der findes på markedet i slutningen af 2018.
Karyotyping software mulighederne, der er omfattet af denne artikel, tilbyder dig en række funktioner, der kan hjælpe dig med at nå dine virksomheds mål.
Ved at bruge denne type software kan du tælle tusindvis af kromosomsstrukturer hurtigt, analysere med forskellige professionelle teknikker og producere højtstående rapporter, der gør det muligt at identificere eventuelle abnormiteter med lethed.
Vi vil gerne vide, hvad din mening angår den software, vi præsenterede i denne top 5 liste. Du er velkommen til at fortælle os ved at bruge kommentarsektionen nedenfor.
RELATEREDE GUIDER, DU TRÆDER FOR AT KONTROLLERE:
- Har du brug for undersøgelsessoftware til akademisk forskning? Her er 5 værktøjer
- 5 bedste software til akademisk skrivning
- 10 bedste plagiatprogrammer til at registrere kopiindhold i 2019
